Собор Св. Руфина — третий крупный храм в Ассизи после церкви Св. Франциска и церкви Св. Клары. Считается, что св. Руфин был первым епископом Ассизи, хотя с исторической точки зрения это утверждение спорно. Согласно другому преданию, так звали раннехристианского мученика, останки которого были привезены в Ассизи Петром Дамиани. Установить истину в вопросе о личности св. Руфина трудно но он, несомненно, считается покровителем города.
Собор Св. Руфина сыграл важную роль в истории ордена францисканцев: именно здесь были крещены св. Франциск, основатель ордена, и его последовательница св. Клара. Позже св. Франциск проповедовал в стенах этого собора. Согласно легенде, когда он произносил здесь свою проповедь, его могли видеть и в других местах, словно он был везде одновременно.
Собор в романском стиле был построен в 1140 г. из камня, добытого на горе Субазио. Фасад церкви довольно строг, все внимание зрителя сосредотачивается на иконографии узкого портала: здесь изображен Христос Пантократор, сидящий между солнцем и луной, Богоматерь с Младенцем и св. Руфин. Над порталом находится окно-«роза», окруженное символами четырех евангелистов — фигурами тельца, льва, орла и ангела. Кампанила XI в. украшена часами с 24-часовым циферблатом, нередко встречающимися в Италии.
В 1571 г. интерьер церкви был полностью переоформлен в стиле итальянского Возрождения, хотя недалеко от входа по-прежнему можно увидеть купель, в которой крестили св. Франциска и св. Клару. Некоторые фрески эпохи Раннего Возрождения, приписываемые Джотто, пережили страшное землетрясение 1997 г. и были отреставрированы впоследствии.
